財政部北區國稅局表示，總機構在中華民國境內之營利事業來自中華民國境外之所得，該所得如係依租稅協定屬於他方締約國免予課稅之所得或依租稅協定適用上限稅率之所得，因未適用租稅協定而溢繳之國外稅額，不得申報扣抵。
該局指出，按所得稅法第3條第2項規定，營利事業之總機構在中華民國境內者，應就其中華民國境內外全部營利事業所得，合併課徵營利事業所得稅，但其來自中華民國境外之所得，已依所得來源國稅法規定繳納之所得稅，得由納稅義務人提出所得來源國稅務機關發給之同一年度納稅憑證，並取得所在地中華民國使領館或其他經中華民國政府認許機關之簽證後，自其全部營利事業所得結算應納稅額中扣抵，扣抵之數，不得超過因加計其國外所得，而依國內適用稅率計算增加之結算應納稅額。惟該中華民國境外所得，如係依租稅協定屬於他方締約國免予課稅之所得或依租稅協定適用上限稅率之所得，未申請適用租稅協定而溢繳之國外稅額，則不得依上開規定自其全部營利事業所得結算應納稅額中扣抵。
該局進一步說明，依適用所得稅協定查核準則第26條第2項規定：「依所得稅協定規定屬於他方締約國免予課稅之所得，或訂有上限稅率之所得，不得申報扣抵其因未適用所得稅協定而溢繳之國外稅額。」是營利事業如有來自中華民國境外之所得，而該所得符合租稅協定規定於他方締約國免予課稅，或依租稅協定適用上限稅率者，其因未適用租稅協定而溢繳之國外稅額，營利事業應向所得來源國申請適用租稅協定退還其溢繳之國外稅額，方屬正確。營利事業如仍有不明瞭之處，歡迎至該局網站(網址為http//www.ntbna.gov.tw)查詢相關法令或利用該局免費服務電話0800-000321洽詢，該局將竭誠提供詳細之諮詢服務
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